上海生物信息技术研究中心成立的“上海市生物信息数据共享服务平台” ，是上海市首批专业技术服务平台之一。 “上海市生物信息数据共享服务平台”由专职从事生物信息数据共享的生命科学数据中心维护，专职服务人员10人，均具有本科以及本科以上学历。对外服务平台是“ 生物信息科学数据共享平台”（http://lifecenter.sgst.cn）,共享平台建立了类型齐全的生物信息科学数据汇交、管理和共享技术体系，不仅包括基因组、蛋白质组和转录组等生物信息资源，还包括药物分子设计、个性化医学等生物信息相关的资源。共享平台支持符合国际数据标准的数据交换标准，并拥有直接支持核酸、蛋白质、基因和文献等书的软件著作权超过30 项，具备为公众和科研机构提供稳定支撑的技术体系和服务能力。平台除了提供生物信息数据资源汇交管理和共享服务外，还提供生物医学数据库发布托管与维护、专业数据库与软件开发、其他软件定制开发和生物信息数据分析等服务。
主要服务项目：
1. 生物信息数据资源汇交、管理和共享
生物信息科学数据共享平台提供基因组、转录组、蛋白质组和文献等生物信息数据的汇交、管理和共享等服务。其中，基因组数据服务对象包括普通核酸序列、EST/STS/GSS等序列表达数据、引物数据、一代测序数据Trace、二代测序数据SRA，以及物种、蛋白质、基因等序列相关的资源，并提供了按照物种进行浏览的基因组数据。共享平台还开发了很多具有特色的特色数据资源，包括癌症差异表达蛋白数据库等以生物学问题为代表的特色数据库，以及以血吸虫、肝炎病毒等生物物种为代表的主题数据库。共享平台开发了乙肝耐药性分析、抗原表位预测等特色的在线计算和综合平台。
2. 生物医学数据库发布、托管与维护 
通过生物信息科学数据共享平台为合作伙伴以及第三方单位提供数据库发布和托管服务，提供共享主机或者独立主机服务。可以根据需求，建立数据自动维护流程，实现数据的定期更新。
3. 专业数据库与软件开发
面向生物医学的科研院所和企业，开发专业数据库和软件，包括以基因组为核心的高通量生物信息数据展示平台，以个性化医疗为重点的数据分析平台，以及针对菌种和细胞等生物资源你的信息管理系统等
4. 其他软件定制开发
为科研单位和企业提供实验室信息管理系统，企业网站门户开发，以及其他软件的定制开发
5. 生物信息数据分析
提供以生物学数据整合、分析为目的的数据分析服务，以及以支持向量机等机器学习方法为核心的数据分析服务
详细内容如下：
深度测序数据分析系列
a) 数据质量控制
b) 拼接/mapping
c) SNV，INDEL等遗传标记发现
d) RNA-Seq
e) Meta-genome数据分析
f) miRNA数据分析
g) 甲基化数据分析
h) 染色体3D数据分析
基因芯片数据分析系列
a) 数据质量控制
b) 转录组数据分析
c) 甲基化数据分析
d) Chip-Chip数据分析
e) GWAS分析
蛋白质组数据分析
a) 数据质量控制
b) 其它常规分析
c) 翻译后修饰分析
临床数据分析
a) 临床指标关联分析
b) 临床指标的统计学习
c) 生存分析
遗传分析
a) 分子进化分析
b) 传统统计遗传分析（遗传标记和表型间关联分析）
c) 广义QTL分析（如eQTL等）
复杂网络推断
a) 基于GeneGO的基因关联网络分析
b) 转录调控网络
c) 基因组上下文关联网络
d) 其它基于假说的统计推断网络
e) 基因网络特性研究
生物医学统计咨询
a) 实验设计
b) 其它相关咨询
生物模型模拟
a) 生物过程构建
b) 数学模型构建
c) 参数估计和模拟
传统基因，RNA，蛋白质的生物信息分析
计算机辅助药物设计
a) 定量构效关系建模
b) 分子对接
c) 全新药物设计
d) 药效团模型