“临床疾病高通量测序服务”采购公告

发布日期:2017-01-17
我单位(上海产业技术研究院)因大数据平台成果转化项目的需要,现联合复旦大学附属肿瘤医院开展针对乳腺癌基因检测的智能化解读平台的构建,推动大数据技术在临床疾病诊疗中的应用与转化。针对这一目标,需要构建肿瘤临床检测的核心数据库,现公开征询“临床疾病高通量测序服务”供应商。本单位将根据公开、公平、公正原则,用产品性价比、客户评价和售后服务质量相结合的方式,选择供应商。
在已有基因检测大数据的基础上,还需要如下样本的测试服务:
1、500例血液样本的BRCA1/2基因检测。要求样本平均覆盖度100x以上,靶区测序深度大于30x达到100%,测序均一度达到100%。对每个样本提供位点分级信息,致病或疑似致病位点Sanger验证。每个样本提供准确、规范的样本检测报告。
2、100例组织样本的转录组测序。要求文库构建时去除细胞质核糖体RNA及线粒体核糖体RNA。每个样本至少10G原始数据量,Q30大于80%。每个样本Mapping rate>70%,文库插入片段中位值200bp以上。提供RNA样本及RNA文库的质量检测报告。每个样本提供准确、规范的样本检测报告及数据分析结果。

测试服务机构资质要求:
要求测试服务机构具有10年以上测序服务经验,在人类基因组、转录组、微生物基因组等方向拥有丰厚积累。与各医院及科研院所在肿瘤及其他复杂疾病的研究具有长期合作,积累有大量数据。具有Sanger测序、二代测序及三代测序平台,及相应配套质控设备、数据存储、数据分析服务器。
服务期限:
服务周期1年。在此期间,完成所有500例血液样本的BRCA1/2基因检测及100例组织样本的转录组测序及分析,并提供数据分析结果和检测报告。

如有意向请提供以下资料密封后送交我单位或扫描后发至相关负责人邮箱:
1、公司介绍;2、应征方案;3、报价;4、售后服务等内容;5、公司营业执照复印件;6、联系方式等资料并加盖公章。
联系人:毛火华
联系电话:021-51371542
邮箱: mhhcxr@aliyun.com
地址:科苑路1278号509室
截止日期: 2017年1月24日17:00(以邮局邮戳日期为准)。截止日期后本单位概不受理。