生物医学大数据:挑战和机遇

发布日期:2013-07-29

  李亦学  上海产业技术研究院研究员 上海生物医学研究院院长


简介 : 

李亦学先生,研究员,博士生导师,上海产业技术研究院生物医学研究院院长,上海生物信息技术研究中心主 任,中国科学院系统生物学重点实验室副主任,上海生物信息学会理事长,中国生物物理学会生物信息学专业

委员会副主任委员,中国生物化学学会分子系统生物学专业委员会秘书长。国家基础科学重大研究计划专项项 目首席科学家,曾任国家“十五”、“十一五”生物医药领域专家组专家、主题专家组长,国家科技发展中长 期战略规划第十五规划组(科技平台组)副组长。现为美国 IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 杂志副主编,英国 BMC Bioinformatics 杂志副主编 , 国内《科学通报》特邀编辑,生物物理 学报、Protein & Cell、生物物理和生物化学学报、生物信息学、中国生物工程杂志以及 Genomics, Proteomics and Bioinformatics 等杂志编委。2000 年回国以来带共发表 200 余篇 SCI 收录科学论文,作为副主编与同行编 写卫生部 7-8 年制临床医学专业教材《生物信息学》一部,主译英文《理解生物信息学》专著一部。获得上海 市自然科学二等奖(排名第一),教育部自然科学一等奖(排名第五),获得上海市科教兴市领军人才称号, 是上海市劳动模范和全国五一国际劳动奖章获得者。

 

摘要 :

2005 年以来,伴随着高通量生物技术特别是新一代测序技术的快速发展和实验成本的大幅度降低,生物医学 大数据呈现爆炸性增长的趋势,海量的数据不断产生出来。过去生物医学研究不敢想、不能做的高通量基因组 学实验现在已经成为常规的实验技术操作。一个基本的事实就是:生物学实验产出海量数据的时间迅速缩短, 成本快速降低,生物医学研究已经开始转变为为数据科学和信息科学,跨入了大数据时代。

当今生物医学研究在某种程度上已经成为拼数据产出量的竞争,在重大疾病的基因组学研究中,一个具体的生 物医学问题,如果没有达到一定的数据产出量,其结果将不会得到同行的承认。但由于生物医学数据和信息的 爆炸性增长的规模超乎想象,大数据产出并没有立刻带来可临床应用的知识的快速增长,信息和数据的爆炸实 际上已经形成了所谓的“数据屏障”,数据的挖掘和知识的发现变得更有挑战性,如不改变这种被动状况,生 物医学海量数据的产出并不一定带来科研的突破,也不能让我们获得和享受大数据带来的“红利”。如何抓住 机会应对大数据带来的挑战,已经是一个摆在我们面前的现实问题,这既有风险、也蕴含着巨大机会。可以相 信:大数据引领的新技术革命到来已指日可待了。